然而，正当王石以为万科上市后就可以高枕无忧的时候，资本给了他一个大招。利用王石早期股权布局的漏洞，成功甩掉了客户，剥夺了王石对万科的控制权。王石被赶出了管理层，最终被迫提前退休。因此，为了确保对阿里巴巴的控制权，马云要求雅虎和软银签署《一致代理协议》，规定对方必须与马云同进退，无条件支持马云做出的任何决定。
三是并购本身给万科带来了很多投资机会。万科本身在物流地产方面也做出了比较明显的动作。类似的并购将有助于新万科新投资模式的出现。从收购后普洛斯的股权结构来看，万科将以21.4%的股份成为普洛斯第一大股东。因此，我们有理由相信，在普洛斯的帮助下，万科未来一定会成功。房地产、物流等领域都变得更加游刃有余，王石离开万科后，郁亮时代终将到来。
1、万科马桥
深圳地铁成为第一大股东后，是否会抑制万科活力？这或许是万科面临危机求变、走向国际化的又一个触发点。与万达、海航、复星的多元化收购不同，万科收购的目的非常明确：加大对物流地产的投资。宝能、华润、安邦分别将其持有的万科股份以每股25元的价格转让给马云和许家印。
2、万科取消所有高管层级
普洛斯在华总资产达122亿美元，总开发面积2670万平方米，其中建成面积1490万平方米，在建面积1170万平方米，另有1210万平方米。平方米土地储备。这还不够。在引入投资之前，马云紧急修改了公司章程，增加了一项条款，规定马云有权任免董事会过半数成员。这保证了马云对董事会的绝对控制权。
3、万科马鞍岛未来之门
而且，它还对公司章程的修改设定了门槛，规定如果任何人想要修改公司章程，必须得到95%股东的同意。马云自己的持股已经达到了8%，所以只要马云不同意，就不会发生变化。一个人可以修改公司章程。对于万科来说，与普洛斯的合作也将有助于实现万科现任董事长于亮长期以来思考的物流地产领域的布局。
4、万科是私企还是国企
而这就是典型的小控股力量。既保证了创始人对公司的绝对控制权，又实现了融资最大化。更重要的是，它可以有效降低风险。即使最后公司出现问题，马云也只需承担向杭州云博投资340万元的有限责任。
不想与宝能有关联的姚振华抓住了机会，利用短期债务和长期投资，在短时间内通过二级市场购买了大量万科股份。仅仅一个月的时间，他就成为万科第一大股东。同时他还和华润达成了协议，彻底断绝了王石复出的可能。最终，他只能交出自己一手创办的做大公司，黯然离开。期刊文章*} 万科辟谣马云出任万科名誉董事长、许家印出任董事长的传言。这是假消息。